Tras su paso por el Albacete de la Segunda División del fútbol español, el mediocampista Martín Fernández se incorporó al Atlante de México.
El volante central uruguayo de 25 años dio sus primeros pasos en las categorías inferiores del Liverpool, cumpliendo cada fase de crecimiento hasta debutar con el primer equipo en el año 2019. Con el negriazul fue clave en el Torneo Clausura que Liverpool obtuvo en 2020. Ya en 2022, tras un buen desempeño, recaló en Boston River, donde llegó a ser capitán.
En enero de 2024 emprendió una nueva aventura en el fútbol argentino siendo cedido a Gimnasia y Esgrima La Plata, volviendo después a Boston River para luego salir traspasado a Newell's Old Boys.
Tras disputar 143 partidos oficiales entre Uruguay y Argentina, el volante partió rumbo a España para incorporarse al Albacete, donde se sumó a mitad de temporada y se convirtió en una pieza muy importante del conjunto albo, siendo habitualmente titular y dejando muy buenas sensaciones.
Finalizado su vínculo con el club español, Martín Fernández inició su nuevo camino en el Atlante, donde este jueves tendrá la posibilidad de debutar cuando el equpo debute en la Liga MX enfrentando como visitante a Necaxa.